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大数据和流行病学有何关系?钟南山曾据此预测2月中旬我国六万人确诊
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来源:上观新闻 作者:黄海华 2020-04-24 17:18
摘要:钟南山团队投稿到国外权威期刊,还被退了回来

“新发突发传染病的防治,就是病毒的意志与人类意志的博弈。”分子微生物学家、中科院院士赵国屏,4月23日下午,在上海科技创新资源数据中心的“小科沙龙”展示了2001年和2017年全球传染病分布图,从中可以清楚地看到,全球传染病暴发总体呈上升趋势。但是2019年的新冠肺炎相比17年前的SARS,生物医学大数据在重大疫情的防控、治疗和研究中发挥了重大的作用。

中科院院士赵国屏

疫情开始时,国外权威流行病学家用数据模型,曾预测中国的确诊病人数将在2月下旬达到高峰,总确诊人数将达24万人。而钟南山团队考虑到武汉封城、全国各地严防死守等措施,通过数据模型,预估中国确诊人数将在2月中旬达到高峰,总确诊病例约六万人。当时,他们投稿到国外权威期刊,还被退了回来,因为编辑们觉得这一预测不太现实。“如今回头看,这一基于数据模型和举国抗疫措施的预测是相当精准的,高峰时段由于诊断措施的调整,延续到了2月下旬;而我国累计报告确诊病例,至今为八万四千左右。”赵国屏说。

“病毒基因组的快速且高质量测定,为病毒的核酸诊断奠定了基础;而病毒基因组序列与确诊人数以千分之三的比例‘实时增长’,也可以帮助我们监控病毒的变异,保证检测的准确性。正因为如此,与17年前的SARS不同,核酸检测一直是确诊的最核心的金标准。” 赵国屏说,抗体检测也在快速跟进。有了抗体检测,就可以更有效地探究人类对于病毒感染的反应,具有回顾和预测的重要研究意义,对于疫苗的研制也有重要的指导作用。所有这些检测数据,如果能够有效地整合,再与临床及流行病学数据整合,真的是非常有意义。但是,要做到这一点,还很不容易。

我是不是感染了新冠病毒?这恐怕是此前很多人心中的疑问。安徽省疾病预防控制中心等单位联合开发了“患者自我诊断决策支持系统”,浏览量超过220万,自评人数超过90万。有意思的是,安徽省约30%的确诊病例与智医助理病历和“患者自我诊断决策支持系统”重叠。大数据切实助力了疫情监测和流行病学调查。

国家生物信息中心2020年1月22日上线了“新冠病毒信息库”,提供全球各数据库数据整合、质量评估、序列下载、动态监控等,用户可通过排序,迅速找出变异最多的变异株等信息。截至4月18日,监测到病毒基因组变异位点4233 个,已为全球165个国家/地区11万余访客提供数据服务,累计数据下载1560万余次。

赵国屏说,数据技术的发展推动了生物信息科学研究的飞速成长,疫情数据为流行病学的统计和研究提供了基础,病毒的变异演化数据可推导流行病例的传播和追踪。通过这次疫情以及我们在疫情中的努力,大家可以感受到推动大数据和防疫控疫的融合应用意义深远。

题图来源:视觉中国 图片编辑:苏唯
文中图片由上海科技创新资源数据中心提供
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